Genotipe karakteristik, standar reaksi, penentuan

Dia genotip Didefinisikan sebagai himpunan gen (dengan alelnya) bahwa mereka mengkodekan untuk fitur atau karakteristik tertentu, yang dibedakan dari yang lain dengan fungsi atau urutan tertentu. Namun, beberapa penulis juga mendefinisikannya sebagai bagian dari genom yang menimbulkan fenotip atau sebagai konstitusi alel dari suatu organisme.

Meskipun terkait, istilah genotipe dan fenotipe tidak sama. Dalam pengertian ini, fenotipe didefinisikan sebagai himpunan karakteristik yang terlihat dari suatu organisme yang merupakan hasil dari ekspresi gennya, dan ke genotipe sebagai himpunan gen yang menghasilkan fenotipe tertentu.

Genotipe dan fenotipe (Sumber: Institut Penelitian Genom Manusia Nasional [Domain Publik] melalui Wikimedia Commons) Genotipe hanyalah salah satu faktor yang terlibat dalam pembentukan fenotipe, karena pengaruh lingkungan dan elemen epigenetik lainnya yang tidak berhubungan langsung terkait secara langsung, karena pengaruh lingkungan dan epigenetik lainnya yang tidak berhubungan langsung secara langsung, karena pengaruh lingkungan dan epigenetik lainnya yang secara langsung tidak terkait langsung secara langsung secara langsung secara langsung secara langsung ke urutan nukleotida juga membentuk karakteristik individu yang terlihat.

Dengan demikian, dua organisme memiliki genotipe yang sama jika mereka memiliki set gen yang sama, tetapi hal yang sama tidak berlaku untuk dua organisme yang tampaknya memiliki fenotipe yang sama, karena karakteristik yang sama dapat menjadi produk dari gen yang berbeda.

Ahli botani Denmark Wilhelm Johansen, pada tahun 1909, yang pertama kali memperkenalkan ke dalam sains istilah genotipe dan fenotipe, dalam buku teks ia berjudul "Elemen -elemen teori tentang warisan yang tepat ", yang merupakan produk dari serangkaian percobaan yang melakukan melintasi garis -garis murni gandum dan kacang polong.

Karya -karyanya, mungkin terinspirasi oleh yang dibuat beberapa tahun sebelumnya oleh Gregorio Mendel, dianggap sebagai "Ayah genetika”, Membiarkannya mengklarifikasi bahwa genotipe suatu organisme memunculkan fenotip melalui proses pembangunan yang berbeda dan di bawah pengaruh lingkungan.

[TOC]

Karakteristik

Genotipe tidak persis sama dengan genom. Berikut adalah perbedaan antara kedua konsep:

- "Genom" mengacu pada semua gen yang diwarisi oleh seorang individu dari orang tua mereka dan bagaimana mereka didistribusikan dalam kromosom dalam nukleus.

- "Genotipe" adalah istilah yang digunakan untuk merujuk, misalnya, ke himpunan gen dan varian mereka yang menimbulkan fitur tertentu, bahwa seseorang dibedakan dalam suatu populasi atau spesies.

Meskipun rentan terhadap perubahan karena mutasi di seluruh sejarah vital suatu organisme, genotipe adalah fitur individu yang relatif tidak berubah -ubah, karena, secara teori, gen yang diwariskan adalah sama dari konsepsi hingga mati hingga mati.

Dalam populasi alami, alel yang membentuk genotipe yang diberikan memiliki frekuensi penampilan yang berbeda; Artinya, beberapa muncul dalam populasi lebih dari yang lain dan ini berhubungan, antara beberapa hal, dengan distribusi, kondisi lingkungan, keberadaan spesies lain, dll.

Istilah "Genotipe liar”Menentukan varian alelik pertama yang ditemukan di alam, tetapi tidak selalu merujuk pada alel yang ditemukan lebih sering dalam suatu populasi; dan istilah "genotipe Mutan“Saat ini digunakan untuk mendefinisikan alel -alel yang berbeda dari alam liar.

Untuk menulis genotipe, huruf kapital dan huruf kecil biasanya digunakan, untuk membedakan antara alel yang dimiliki seseorang, apakah homozigot atau heterozigot. Huruf kapital digunakan untuk mendefinisikan alel dominan dan huruf kecil untuk resesi.

Aturan Reaksi Genotipe

Individu mewarisi gen orang tua mereka, tetapi bukan produk akhir yang diperoleh dari ekspresi mereka, karena mereka bergantung pada banyak faktor eksternal dan sejarah perkembangan mereka.

Menurut ini dan hanya merujuk pada faktor lingkungan, genotipe dapat menyebabkan lebih dari satu fenotipe. Hasil "hasil" yang mungkin dari interaksi genotipe spesifik dengan lingkungan yang berbeda adalah apa yang disebut oleh para ilmuwan "aturan reaksi genotipe".

Norma reaksi suatu genotipe adalah semacam "kuantifikasi" atau pendaftaran karakteristik yang terlihat yang diperoleh dari interaksi genotipe dengan lingkungan tertentu. Itu dapat dinyatakan sebagai grafik atau tabel yang "memprediksi" hasil yang mungkin.

Jelas, tentu saja, bahwa standar reaksi hanya merujuk pada genotipe parsial, fenotip parsial dan beberapa faktor lingkungan, karena dalam praktiknya sangat sulit untuk memprediksi semua interaksi dan semua hasil dari ini.

Bagaimana genotipe ditentukan?

Tentukan genotipe atau "genotipifikasi" suatu organisme atau populasi individu dari spesies yang sama, memberikan banyak informasi berharga mengenai biologi evolusionernya, biologi populasinya, taksonomi, ekologi dan keragaman genetiknya.

Dalam mikroorganisme seperti bakteri dan ragi, karena mereka memiliki tingkat multiplikasi dan mutasi yang lebih tinggi daripada sebagian besar organisme multiseluler, menentukan dan mengetahui genotipe memungkinkan untuk mengendalikan identitas koloni dalam koleksi, serta menetapkan beberapa karakteristik epidemiologi, ekologi dan taksonomi yang sama.

Untuk menentukan genotipe, perlu untuk mendapatkan sampel organisme yang ingin Anda kerjakan, dan jenis sampel yang diperlukan akan tergantung pada setiap organisme. Pada hewan, misalnya, sampel jaringan yang berbeda dapat diambil: ekor, telinga, tinja, rambut atau darah.

Genotipe suatu organisme dapat ditentukan secara eksperimental berkat penggunaan beberapa teknik modern, yang akan tergantung pada lokasi genom gen untuk dipelajari, anggaran dan waktu, kemudahan penggunaan dan tingkat kinerja yang diinginkan.

Saat ini, teknik yang digunakan untuk genotipifikasi suatu organisme meliputi, sangat sering, penggunaan dan analisis penanda molekuler untuk mendeteksi polimorfisme dalam DNA dan teknik lain yang lebih canggih yang menyiratkan pengurutan genom genom.

Lebih banyak penanda karyawan

Di antara penanda yang paling banyak digunakan kami menemukan yang berikut:

- RFLP (polimorfisme fragmen pembatasan).

- AFLPS (fragmen panjang yang diamplifikasi polimorfisme).

- RAPDS (DNA polimorfik yang diamplifikasi secara acak).

- Mikrosatelit atau SSR (urutan sederhana yang diulang).

- ASAP (primer yang terkait dengan alel spesifik).

- SNP (polimorfisme nukleotida sederhana).

Teknik yang menggunakan pengurutan dan hibridisasi

Dan di antara teknik yang menggunakan sekuensing spesifik dan hibridisasi probe spesifik adalah:

- Diurutkan dengan metode Sanger.

- Genotipifikasi kinerja tinggi.

- Latihan "GoldenGate“Dari Illumina.

- Sequencing Genotipification (GBS).

- Esai Taqman.

- Sequencing Generasi Baru.

- Microarrers.

- Sequencing genom penuh.

Referensi

1. Griffiths, a., Wessler, s., Lewontin, r., Gelbart, w., Suzuki, d., & Miller, J. (2005). Pengantar analisis genetik (Edisi ke -8.). Freeman, w. H. & Perusahaan.
2. Klug, w., Cummings, m., & Spencer, C. (2006). Konsep genetika (Edisi ke -8.). New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, hlm.-DAN. (2001). Metode untuk genotipe polimorfisme nukleotida tunggal. Annu. Putaran. Genomik Hum. Genet., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, m. (1997). Apa sebenarnya genom, genotipe, dan fenotipe? Dan bagaimana dengan fenanya ? J. Theor. Biol., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, L. L. (1999). AFLP Genotip dan sidik jari. Pohon, 14(10), 389-394.
6. Institut Kesehatan Nasional. Diperoleh 14 Mei 2019, dari www.Nih.Pemerintah/
7. Patel, d. KE., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Kemajuan dalam Genotip Tanaman: Di Mana Masa Depan Akan Membawa Kita. Dalam j. Batley (ed.), Genotip Tanaman: Metode dan Protokol (Vol. 1245, hlm. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, b. (2012). Genetika: Pendekatan Konseptual. Freeman, w. H. & Perusahaan.
9. Schleif, r. (1993). Genetika dan molekuler biologi (Edisi ke -2.). Maryland: The Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, b. (2014). Metode genotipe. Di sebuah. Filloux & J. L. Ramos (eds.), Metode dalam Biologi Molekuler (Vol. 1149, hlm. 33-47). New York.
11. Yang, w., Kang, x., Yang, q., Lin, dan., & Fang, m. (2013). Tinjauan tentang pengembangan metode genotip untuk menilai keragaman hewan ternak. Jurnal Ilmu Hewan dan Bioteknologi, 4(2), 2-6.